不同厂商的SD-WAN路由器在互联互通方面通常面临着多重挑战，特别是在网络兼容性和技术标准的差异上。各厂商可能采用不同的协议、加密方式和管理架构，使得不同设备间的互联互通变得复杂。这种技术上差异化的现象往往导致一体化网络架构的实施受到阻碍，影响了整体网络效能。
安全性也是一个重要因素，栅栏式防火墙和不同的加密技术可能会让不同品牌的设备之间的连接受限。某些厂商可能实施了严格的安全规程，而这些规程却与其他厂商的解决方案产生了冲突，妨碍了数据的顺畅交换。这种情况下，管理员需要花费更多时间来进行配置调整和安全策略的梳理。
用户界面的差异性同样是一个不容忽视的问题。不同厂商的设备在管理界面和操作流程上的设计各异，造成了用户在管理时的混淆。这在多供应商环境下尤其明显，运维人员常常需要额外培训从而使其熟悉每种设备的操作流程，这增加了实施和维护的复杂度。
协议支持也是影响互联互通的关键要素。许多设备只支持特定的网络协议，如某些厂商可能只兼容最新的SD-WAN协议，而其他设备则可能依赖于传统的VPN技术。缺乏统一的协议支持机制妨碍了不同厂商设备的无缝对接，限制了网络的灵活性和可扩展性。
运维层面的差异化则体现在设备监控和故障排查上。不同厂商的设备提供的监控工具和报告能力完全不同，这使得故障排查过程变得更加繁琐。运维团队需要使用多种监控工具来保证网络的稳定性，这加重了其负担。
运营商的策略也会影响到SD-WAN的互联互通。在一些情况下，运营商可能会限制某些流量或协议，这在多运营商环境中更为明显。由于不同运营商之间的政策差异，数据传输的顺畅性受到影响，进一步增加了网络连接的挑战。
软件更新和兼容性也是一个需要重视的问题。随着技术迅速发展，不同厂商设备的更新频率和更新内容不尽相同，可能导致版本之间的不兼容。在这样的情况下，现有的网络可能需要频繁进行调整，以适应新的更新，这无疑会增加管理上的复杂性。